福建东山珊瑚礁海洋自然保护区，保护海洋生物栖息、繁殖、生长、索饵的重要场所，保护海洋生物多样性，同时与旅游结合，发展海洋生态旅游业，并成为国际开展海洋基因库研究和开发基地。

东山岛是位于福建南部的海岛县（准备建市）和渔业县。东山水域跨北回归线，是中国海和西太平洋最典型的亚热带海域。珊瑚礁是热带海域的标志，东山有大量不成礁的石珊瑚，标志着东山水域的亚热带性质。东山水域受闽粤沿岸流、黑潮暖流和南海暖流等多种流系支配。东山是闽南渔场的中心，周围海域有着极为丰富的鱼、虾、贝、藻资源。

经初步调查，已在东山发现8种石珊瑚。其中锯齿刺星珊瑚和标准蜂巢珊瑚是本地优势种，分布在东山本岛东部及东南岩礁海岸低潮区至潮下带10多米的海域，也分布在本岛周围的小岛，如东门屿、对面屿、大坪屿及澳角附近的虎、豹、狮、象屿等等，详细分布和数量待查。锯齿刺星珊瑚呈块状，几十公斤至几十吨大小不等。东山沿岸的珊瑚是龙虾、石斑鱼和鲷科鱼类以及杂色鲍、华贵栉孔扇贝等名贵鱼、虾、贝的良好栖息场所。

东山位于北回归线上，是中国海和西太平洋最典型的亚热带海域，受闽粤沿岸流、黑潮暖流和南暖流等多种流系所支配，海洋生物资源丰富，共记录各类海洋生物1242 种，初级生产力水平高，年平均 142mg/m2，东山海域有大量造礁的石珊瑚，是石珊瑚分布的北缘，而珊瑚礁是热带海域的标志，珊瑚礁形成的立体空间，构成了独特的珊瑚礁生态系统，这个系统中生产力中最高，物种最丰富，被称为海的绿洲，可以与热带雨林的生物多样性相媲美。