在高原湿地中，鸟的数量多且分布集中，沙鸥翔集，鹤鸣九皋，平沙落燕，很多湿地被誉为珍禽王国或候鸟“天堂” 。我国的高原湿地、冰川是长江、黄河以及国际河流澜沧江、恒河、印度河的发源地，也是珍稀野生动物的避难所。由于独特的自然条件，同时伴随青藏高原隆起和古地理环境的变迁，使这里既保留了古老的物种，同时也产生了许多新的种属，成为现代物种的分化和分布中心。这里野生动物的特点是珍贵稀有、物种丰富、资源储量可观。一些耐寒喜凉的生物在与大自然的残酷斗争中获胜并得到繁殖和发展。青藏高原上的湿地鸟类，与其他物种一样，在地球上与人类共存，是重要的自然资源，它们是湿地生态系统的重要组成部分，它维持了高原生态系统的平衡，使得人类的生存环境更加稳定，更加幽雅壮美。澜沧江、怒江水系和雅鲁藏布江水系属高原河流，鱼类种数多，以裂腹亚科、鲃亚科等鱼类居多，同时也有许多特有种。三江源地区有 70 多种珍稀沼泽动物，其中国家一级重点保护野生动物有藏羚羊、白唇鹿、水鹿、雪豹、雪鸡等 20 多种。横断山区共有珍稀沼泽动物 24 种，其中黑颈鹤、白鹳、黑鹳、金雕、玉带海雕和白唇鹿等属于国家一级重点保护动物；大天鹅、小天鹅、疣鼻天鹅、鸢、灰鹤、白臀鹿、水獭等属于国家二级重点保护动物。而且黑颈鹤、白唇鹿、白臀鹿等沼泽动物也是我国高原特有种。

黑颈鹤是世界上唯一一种生长、繁殖在高原的鹤类，是我国特有的珍稀鸟类，被视为神圣的吉祥鸟，且与史诗中的格萨尔王相联系。黑颈鹤的分布区域狭窄。目前，世界上仅存的黑颈鹤在中国大陆繁衍栖息，大部分分布在我国的青藏高原、云贵高原和四川北部地区。目前，全世界有黑颈鹤约6000只，我国西藏是最大的越冬地，每年在雅鲁藏布江河谷、拉萨河河谷一带有4000只左右的黑颈鹤越冬。自1992年以来，在云贵高原越冬的黑颈鹤不断增长，到目前为止，每年冬季到贵州草海自然保护区和云南大山包国家级自然保护区的黑颈鹤已达1500只以上，成为仅次于青藏高原的全球第二大黑颈鹤越冬地。

白唇鹿是渗入型沼泽湿地动物，生活在海拔为3500～5000m的高山， 到沼泽中进行饮水、觅食或洗浴；喜欢群居生活，群体数量一般为10 ～ 30 只；嗅觉敏锐，十分机警，善于奔驰。食物以禾本科、莎草科、蓼科、蔷薇科等多种草本植物和山柳、高山栎、杜鹃等灌木的嫩枝、叶和树皮等为主。

白臀鹿也是渗入型沼泽湿地动物，白天隐蔽在草丛或林缘灌丛中，早晨和黄昏开始活动。它们在沼泽中饮水、觅食，有喜欢舔食盐土与盐水的习性，多呈小群活动。食物以豆科、禾本科、菊科、蓼科和灌木嫩枝、树皮等为主。我国高原湖泊湿地众多，类型多样，孕育了多种浮游动物、底栖动物和鱼类，根据所在区域不同，形成了区域特有种，并成为这些物种繁衍生存的特殊场所。云贵高原湖泊湿地 特有种有4种贝类 （螺蛳、光肋螺蛳、阳宗海螺蛳、绘环棱螺） ，1 种虾类（喻氏沼虾） ，3 种枝角类（云南高壳溞、尖吻低额溞、翼弧溞） ，11 种挠足类和以鲤属和白鱼属为主的一些鱼类。

蒙新高原湖泊湿地 特有种有 5 种枝角类（长柱尾突溞、新疆平直溞、粗刺大尾溞、锯瓜弯尾溞、蒙古秀体溞） ，10 种桡足类和以雅罗鱼亚科及条鳅亚科为主的一些鱼类。

青藏高原湖泊湿地 本湖区有很多新种和特有种，如轮虫有 3 个新种和新亚种及 93 个特有种，枝角类 3 个新种（戎装秀体溞、喜马拉雅低额溞、阿里尖额溞）和 4 个特有种（耳形船卵溞，帕米尔溞，波纹盘肠溞，高原角壳溞）和桡足类 2 个特有种（新月北镖水溞，西藏指漂水溞） 。

青藏高原由于受人为干扰少，因而许多湿地成为鸟类的天堂。在西藏发现有 20 多个鸟岛，面积大小不等，多分布在海拔 4200 ～5000m 的淡水和微咸水湖中，岛上鸟类密度为1 ～ 2 只 /m²， 有些小岛上鸟类数量超过1万只，主要有棕头鸥、鱼鸥、斑头雁等鸟类。青海省的鸟岛自然保护区，是我国首批被列入国际重要湿地名录的湿地之一，主要由鸟岛及其附近的泉湾沼泽湿地构成，是许多候鸟迁徙转移的重要驿站。据初步统计，青海湖盆地鸟类超过180 种，其中水鸟 61 种，著名的珍稀物种有黑颈鹤、灰鹤、大天鹅、斑头雁，棕头鸥等。